Alper BABAOĞLU 1960 yılında Elbistan-Kahramanmaraş'ta doğdu. İlk, Orta ve Lise eğitimini Elbistan'da tamamladı. Karadeniz Teknik Üniversitesi Mühendislik ve Mimarlık Fakültesi İnşaat Bölümü'nden 1982 yılında mezun oldu.

1985 yılında İller Bankası Kanalizasyon Dairesi Başkanlığı'nda göreve başladı. 1992 yılında Banka'dan ayrılarak özel sektörde çalıştı.

2005 yılında İller Bankası Etüt Plan ve Yol Dairesi Başkanlığı'nda göreve başladı.

2008 yılı Ekim ayında Yapı İşleri Dairesi Başkanlığı'na vekâleten görevlendirildi .

Şubat 2010 yılında Üst Yapı Uygulama Dairesi Başkanlığı'na Daire Başkanı olarak atandı ve halen bu görevi yürütmektedir.

Evli ve 4 çocuk babasıdır.